Novice profesorjev

Na Katedri za biokemijo iščemo študenta, ki bi opravljal diplomsko delo s predvidenm naslovom: Študij toroidne membranske pore s pomočjo površinske plazmonske resonance

Metoda površinske plazmonske resonance se uporablja za študij molekularnih interakcij. V zadnjem času še posebej za interakcije nekaterih snovi, npr. proteinov ali zdravil, z lipidnimi membranami.
Proteini in peptidi lahko poškodujejo celične membrane na različne načine. Bistvo vseh je, da pride do tvorbe por, ki neselektivno prepuščajo znotrajcelične snovi. Celica se posledično odzove z vrsto fizioloških odzivov, v skrajnem primeru umre. Toroidni model transmembranske pore predvidi, da steno pore tvorijo ne samo peptid ali protein, temveč tudi membranski lipidi. Cilj diplomskega dela je razvoj sistema za spremljanje toroidne transmembranske pore, ki bo omogočil vpogled v delovanje nekaterih citolizičnih proteinov s katerimi se raziskovalno ukvarjamo na Katedri za biokemijo, predvsem človeški perforin, citolizine iz morskih vetrnic, bakterijske citolizine, itn.

V diplomskem delu bo študent:
1. Pripravil sistem za spremljanje tvorbe pore na osnovi površinske plazmonske resonance.
2. Preveril ali nekateri znani citolizini uporabljajo toroidni model tvorbe pore pri svojem delovanju.

Diplomsko delo bo potekalo v okviru Infrastrukturnega centra za površinsko plazmonsko resonanco (http://web.bf.uni‐lj.si/bi/sprcenter/) in bo v celoti opravljeno na Katedri za biokemijo, Oddelka za biologijo. Študent se bo med delom seznanil s pripravo liposomov, površinsko plazmonsko resonanco in nekaterimi proteini (vsi so že na razpolago v laboratoriju), ki reagirajo z membranami. Z delom se lahko prične takoj. Delo je primerno za študente biologije, biokemije, biotehnologije in mikrobiologije.

Vsi zainteresirani kandidati naj se oglasijo po e‐pošti na gregor.anderluh@bf.uni‐lj.si.